Existe uma riqueza de espécies nativas no Rio Grande do Sul, que historicamente foram negligenciadas ou pouco utilizadas, como jabuticaba, butiá, guabiroba, araçá, que fazem parte da cultura local. Os técnicos do Centro de Tecnologias Alternativas e Populares (Cetap), que é uma Organização Não Governamental (ONG) do município de Passo Fundo (RS), identificaram a possibilidade de geração de renda para os agricultores familiares ecologistas, situados em oito regiões do estado do Rio Grande do Sul, por meio da coleta de frutas das espécies nativas existentes em suas propriedades. A cadeia das fruteiras nativas surgiu para o promover desenvolvimento com geração de oportunidades aos agricultores familiares ecologistas. Além disso, é uma das cadeias produtivas que mais se projeta como estratégica e com potencial de crescimento no Rio Grande do Sul. Entretanto, carece de informações técnicas organizadas que permitam avançar na estruturação de todos os elos dessa cadeia produtiva. O objetivo deste trabalho é fazer o levantamento de fungos associados a sintomas de doenças que possam comprometer o potencial produtivo das fruteiras nativas. A metodologia utilizada será: a) coleta de informações e amostras de plantas com sintomas que caracterizem doenças com dano potencial às fruteiras  na região norte do Rio Grande do Sul, mais especificamente no município de São José do Ouro; b) pesquisa bibliográfica específica; c) observação das estruturas fúngicas presentes nas lesões das amostras,  utilizando o estereomicroscópio e microscópio; d) comparação das hipóteses geradas pela pesquisa bibliográfica com as observadas nas amostras; e) análise e identificação dos gêneros fungicos presentes através das características morfológicas; f) tabulação dos dados; g) cálculo das frequências relativas dos gêneros fúngicos associados e das fruteiras hospedeiras. Os resultados preliminares deste trabalho são: a) os principais sintomas de doenças encontrados nas fruteiras nativas são manchas foliares; b) Dentre nove fruteiras nativas já avaliadas houve 3 gêneros fúngicos predominantes associados aos sintomas de manchas foliares: Puccinia sp. (28,6%), Colletotrichum sp. (21,4%) e Cercospora sp. (14,3%).  Este trabalho de pesquisa irá agregar informações importantes para viabilizar o manejo das fruteiras nativas em sistemas produtivos agroflorestais da região.